RNAの品質確認

バイオアナライザーという機械でRNAの品質を確認。

28Sと18Sのピークがシャープで、ベースラインが低いことが分解されていない高品質のRNAであることを示しているらしいのだが・・・。

ソフトによると28Sに相当するピークがないと判断され、非常に劣化したRNAであると判断されてしまう。このサンプルはRIN（RNA Integrity Number）＝5.1と判断された。（RIN>8以上が理想）

実はこれは昆虫に特有の現象らしく、測定前の温度処理（2本鎖を1本鎖にする）によって28Sが2つに分解されてしまうらしい。そのせいで18Sとオーバーラップしてみえるという。

波形から見て、おそらく今回のサンプルはほとんど問題ないはず。

以下の論文に説明がある。

• Winnebeck EC, Millar CD, Warman GR (2010) Why does insect RNA look degraded? Journal of Insect Science 10: 159.